Cada distribución Linux usa un Kernel de acuerdo a su deseos y necesidades la mayoria también incluyen parches para construir Kernels genericos para cualquier tipo de computadora PC y compilados para que funcionen en casi todas las PC, ahora bien en el caso de gentoo tiene kernels

parchados de acuerdo a cada necesidad para ser aplicados de una forma no tan generica ya que para cada arquitectura tienen por los menos un par de versiones con distintos tipos de parches, a continuación comento un poco cada version de kernel y sus aplicaciones, esta información la encontre en http://gentoo.neysx.org/doc/es/gentoo-kernel.xml

Para uso general: gentoo-sources

Para la mayoría de los usuarios, las fuentes recomendadas para el
kernel son los gentoo-sources. Desde la versión 2005.0, Gentoo
Linux utiliza la rama 2.6 como kernel por defecto. A menos que esté
usando específicamente el perfil 2.4, los gentoo-sources serán
un kernel 2.6 en la mayoría de arquitecturas.

gentoo-sources es un kernel basado en Linux 2.6, ligeramente parcheado
para arreglar errores, problemas de seguridad, y para incrementar la
compatibilidad con las arquitecturas menos comunes. Linux 2.6 es el actual
árbol estable del kernel y su desarrollo está avanzando rápidamente. Para el
mayor rendimiento, mejor soporte de hardware y un amplio juego de
características nuevas, recomendamos la 2.6 sobre la versión 2.4 más antigua
equivalente.

Los parches del kernel gentoo-sources 2.4 son similares a los incluidos
en sus versiones 2.6 equivalentes más un conjunto de parches diseñados para
añadir funcionalidad y mejorar el rendimiento.

El paquete gentoo-sources absorbe la mayoría de los recursos
del equipo del kernel Gentoo. Son el producto de perspicaces
desarrolladores que además cuentan con los conocimientos del popular
hacker del kernel Greg Kroah-Hartman, mantenedor de udev y responsable
de los subsistemas USB y PCI del kernel oficial Linux.

Para servidores: hardened-sources y rsbac-sources

hardened-sources está basado en el kernel Linux oficial y está
dirigido a nuestros usuarios que corren Gentoo como servidores
dedicados. Provee parches para la mayoría de los subproyectos de
Gentoo Hardened (tales como el soporte para LSM/SELinux y grsecurity) junto con mejoras para
las estabilidad y la seguridad. Como con las gentoo-sources,
éste viene en versiones 2.6 y 2.4. Revise
http://www.gentoo.org/proj/en/hardened/ para más
información.

rsbac-sources contiene parches para utilizar Rule Set Based
Access Controls (RSBAC) tanto
en sabores 2.4 como en 2.6. Es mantenido por el proyecto RSBAC, un subproyecto
de Gentoo Hardened.

Importante:
Estos kernels proporcionan potentes parches para mejorar la
seguridad. Por favor, lea la documentación antes de usarlos.

También hay kerenels que incluyen parches que los desarrolladores de gentoo no tienen nada que ver y que dan soporte como los siguientes:

ck-sources

ck-sources es el conjunto de parches de Con Kolivas,
principalmente diseñado para mejorar la sensibilidad e interactividad
del sistema y es configurable para cargas de trabajo variables (de
servidores a sistemas de escritorio). Además, ya es totalmente maduro;
ha sido sometido a multitud de reincidencias de desarrollo y
modelamiento. El vigor de cada lanzamiento está en su estabilidad y
seguridad. El soporte y la información está disponible en
http://kernel.kolivas.org y en el canal #ck de
irc.oftc.net.

git-sources

El paquete git-sources sigue las imágenes diarias de los
desarrolladores (upstream) de la rama del kernel de
desarrollo. Debería utilizar estos kernels en caso de estar interesado
en el desarrollo o testeo de los mismos. Los informes de fallos deben
ir al sistema de seguimiento de
fallos del kernel Linux o a la lista de correo del kernel Linux
(LKML, Linux Kernel Mailing List).

mm-sources

Las mm-sources se basan en los vanilla-sources y
contienen el conjunto de parches de Andrew Morton. Incluyen las
características experimentales y más punteras que serán incluidas en
el kernel oficial (o que van a ser rechazadas porque hacen que su
máquina se queme). Este conjunto de parches es conocido por su
desarrollo a paso agigantado y cambian radicalmente de una semana a
otra; los hackers lo usan como terreno de prueba para novedades.

Si desea vivir al borde y cree que los vanilla-sources son
para los débiles, entonces pruebe mm-sources. Le advertimos que
este kernel es altamente experimental y que las cosas no suelen
funcionar tal como deberían.

openvz-sources

OpenVZ es una solución para crear en Linux servidores
virtuales. OpenVZ crea servidores virtuales privados (VPSs, Virtual
Private Servers) seguros e independientes o entornos virtuales en un
único servidor físico permitiendo una mejor utilización del mismo y
asegurándose que las aplicaciones no entren en conflicto. Para más
información, visite http://www.openvz.org.

suspend2-sources

Las suspend2-sources están parcheadas con ambos genpatches que
incluyen los parches encontrados en gentoo-sources y Software Suspend 2 el cual es una
nueva y mejorada implementación de suspend-to-disk para el Kernel de
Linux.

Este kernel es recomendable para usuarios de ordenadores portátiles
que a menudo confían en ser capaces de suspender sus portátiles y
reanudar el trabajo en otro lugar.

usermode-sources

Las usermode-sources son los parches para el kernel User Mode
Linux. Este kernel está diseñado para correr Linux dentro de Linux
dentro de Linux… User Mode Linux es para prueba y para soporte de
servidores virtuales. Para más información acerca de este
extraordinario tributo a la estabilidad y escalabilidad de Linux, vea
http://user-mode-linux.sourceforge.net.

Para más información acerca de UML y Gentoo, lea la Guía UML de Gentoo.

vanilla-sources

Las otras fuentes del kernel con las que la mayoría de usuarios estarán
familiarizados como usuarios Linux son las vanilla-sources. Estas son
las fuentes oficiales del kernel publicadas en
http://www.kernel.org/. Por favor, tome nota de que nosotros no
parcheamos estos kernels – simplemente están para aquellas personas que deseen
utilizar un kernel Linux de serie, sin ninguna modificación. Le recomendamos
que, en su lugar, utilice gentoo-sources.

De forma parecida a gentoo-sources, existen dos versiones del
kernel bajo este paquete: 2.4 y 2.6.